ThermoTargetMiner: a thermal proteome stability database for identification of protein targets and action mechanisms of novel anticancer agents

Bakgrund

Datatrivena metoder för måluppfyllelse / validering vid narkotikasökning och utveckling, såsom anslutningskartor, blir överlägset populära. Utnyttja vår senaste innovation, kallad Proteome Integral Solubility Alteration (PISA) -analys, som är en genomgångsversion av Thermal Proteome Profiling (TPP eller CETSA-MS). Detta projekt syftar till att bygga den första delen av en cellulär protein stabilitets databas (ThermoTargetMiner) som svar på 200 anticancerföreningar i 3 viktiga cancercellinjer. ThermoTargetMiner kan sedan användas för kartläggning av målen för nya antikankerföreningar.

Beskrivning

Detta projekt syftar till att bygga den ThermoTargetMiner, som kan sedan användas för kartläggning av målen för nya antikankerföreningar. Denna resurs kan också kombineras och användas tillsammans med vår senaste online-resurs som heter ProTargetMiner, som bygger på förändringar i proteinöverflöd, för omfattande karaktärisering av mål och mekanism för åtgärder (MOA) av små molekyler. Den utvecklade plattformen kommer att vara offentligt tillgänglig online tillsammans med analysverktyg. Sådan förmåga kan avsevärt öka svensk cancerforskning, som i slutändan syftar till utveckling av effektiva läkemedel mot cancer.

Mål

Vi hoppas att minska tiden från upptäckten en molekyl som dödar cancerceller för att maing ett läkemedel från den molekylen.