Function and regulation of a cancer-associated remodeler

Sebastian Deindl
Uppsala universitet
2020
Finansieras med
2 400 000 kr
Forskningsområde: preklinisk forskning

Bakgrund

För att få plats inne i kärnan kan genetisk information packas i ett mycket kompakt tillstånd som kallas kromatin. Denna förpackning av DNA i form av kromatin reglerar många viktiga cellulära processer, som behöver tillgång till cellens genetiska material. En viktig klass av enzymer, som ansvarar för att reglera strukturen på kromatin, är ATP-beroende kromatinremodellerare. Dessa enzymer utnyttjar energin från ATP hydrolys för att dynamiskt ändra strukturen på kromatin. De spelar viktiga roller i många grundläggande biologiska processer, från DNA-replikation, reparation, rekombination och transkription till reglering av beslut om cellens öde.

Beskrivning

Dysfunktion av kromatinremodellerare kan orsaka en rad cancerformer. Att bestämma de funktionella rollerna hos kromatinremodellerande enzymer och utveckla nya terapier för att bekämpa cancersjukdomar relaterade till deras dysfunktion kräver en mekanistisk förståelse av de biokemiska och biofysiska principerna bakom kromatinremodellering och dess reglering.

Mål

I detta projekt kommer vi att utveckla kraftfulla, nya singelmolekyl-biofysik-metoder och kombinera dem med kryoelektronmikroskopi (cryo-EM) och röntgenkristallografi för att undersöka strukturerna såväl som deras konformationsdynamik (som tillsammans möjliggör funktion och reglering) av ett representativt och hälsorelevantkromatinremodellerande enzym.Vi hoppas härleda kritiska och nya mekanistiska insikter vilket kan belysa sambandet mellan dess dysfunktion och cancersjukdomar.