Chromatin and long non-coding RNA in Ribosomal Transcription; Dysregulated in Cancer

Bakgrund

Många grundläggande processer avregleras i cancerceller, t.ex. ribosomal transkription vilken behövs för proteinsyntes och är därför viktig för celltillväxt och vid celldelning. Ribosomal transkription avregleras av onkogener, men också av att kromatinpackningen av DNA vid dessa gener är uppluckrad. Enzym som påverkar kromatinstrukturen har visats ofta vara uppreglerade eller muterade i cancer, och då kan gener öppnas och detta påverkar också de ribosomal generna. Ribosomal transkription och dess reglering är ett område som är lite studerat, även om inhibitorer har utvecklats som har potential att tas i bruk som cellgifter i cancerbehandling.

Beskrivning

I detta projekt studerar vi enzymkomplex som B-WICH som ändrar kromatinstrukturen över ribosomala rRNA genernas promotor och därmed ökar transkriptionen. I vissa cancerceller har vi sett att dessa är överuttryckta och då kan ribosomal transkription avregleras, vilket möjliggör celldelning och till och med metastaiser . Vi vill förstå de underliggande molekylära mekanismerna, hur komplexet rekryteras och hur det samverkar med andra komplex och lon non-coding RNA" som stänger av generna genom att packa de tätt. Dessutom skyddar en hårdare packning, heterokromatin, mot DNA-skador och om uppluckring sker, skulle ökade DNA-skador bli ett resultat.

Mål

Vi vill också studera samband med andra processer som avregleras i cancer, såsom metabolism och DNA reparation. Detta projekt kommer att öka förståelsen av grundläggande processer som medverkar i cancerprogression. Vi kommer att få ökade insikter i samspelet mellan olika kromatinremodellerande komplex i reglering av ribosomal genuttryck. Ökad förståelse av dessa processer ökar också möjligheten för utvecklandet av behandlingar och läkemedel och genom att också förstå samband mellan ribosomal transkription och andra viktiga processer i cellen kan inhibitorer och cellgifter kombineras för optimalt resultat.