Uhlén, Per Edvin – Spatial Single-Cell Analysis of Proteins and RNAs in the Tumor Microenvironment by 3D Imaging

Bakgrund

Tumörens mikromiljö är det ekosystem som omger en tumör inuti kroppen. Det inkluderar immunceller, den extracellulära matrisen, blodkärl och många andra celltyper. Tumörens komplicerade mikromiljö försvårar diagnostik och behandling. Vanligen utförs histopatologiska studier av tumörer genom att tumören snittas i tunna skivor som undersöks med 2D mikroskopi. I det här projektet ska vi studera intakta tumörer genom att först göra dem transparanta för ljus och sedan avbilda dem med 3D mikroskopi. Det ger ökad kunskap om tumörens mikromiljö vilket i framtiden kan leda till förbättrad diagnostik och individanpassad cancerbehandling.

Beskrivning

Vi kommer studera mikromiljön i vävnadsprover från bröstcancer och urinblåsecancer. Tillsammans med patologer på kliniken väljer vi preparat som är utmanande att diagnostisera. Vävnaden görs genomskinlig för ljus och avbildas med avancerad 3D imaging. Vi vill förstå vad som skiljer tumörer som svarar på immunterapi med s.k. PD-L1 hämmare med dem som inte svarar. Tumörens vaskulärsystem kommer också studeras samt nya potentiella prognostiska markörer för t.ex. cancerstamceller och microRNA. Vi avser också att optimera vår 3D imaging-metod så att experimenten kan utföras snabbare, med högre upplösning och innefatta fler antal markörer.

Mål

Detta projekt hoppas uppnå ökad kunskap om tumörens mikromiljö och hur den påverkar diagnostiseringen. Vi vill besvara varför vissa patienter svarar på immunterapi och andra inte. Vi vill kartlägga tumörcellers, immuncellers och cancerstamcellers uttrycksmönster i tumören i tre dimensioner och förstå hur dessa celler interagerar med blod- och lymfkärlen. Vi hoppas att vår forskning i framtiden kan bidra till att translatera avancerade 3D imaging-tekniker till kliniken för att förbättra diagnostiseringen och individanpassad cancerterapi.