Borg, Kurt Olof Åke – Molecular characterization of breast cancer: biomarkers of risk, prognosis and treatment

Bakgrund

Bröstcancer (BC) är en heterogen sjukdom både avseende tumörbiologi och kliniskt förlopp. En noggrann karakterisering av konstitutionella genetiska varianter, förvärvade somatiska mutationer och förändrade gen-uttryck medger bättre möjligheter att bedöma risk, ger en mer nyanserad tumörklassificering och bättre förutsägelse av prognos och behandlingssvar.

Beskrivning

Projektet utnyttjar etablerade populations-baserade resurser och nätverk. I det nationella SWEA projektet har screening av 4600 familjära BC fall utförts. Validerade gener har införts i klinisk genetisk rutin vid ärftlig BC. I SCAN-B studien har >18000 BC patienter inkluderats och RNA från >12000 primärtumörer har sekvenserats. RNA-seq klassificerare överensstämmer väl men ger även ett mervärde till etablerad histopatologi. RNA-seq molekylär subtyp och ROR (risk of recurrence) har införts kliniskt i södra Sverige. Helgenom-sekvensering identifierar genomiska mönster som antyder defekt DNA-reparation och predikterar svar på kemo-behandling.

Mål

Gen-signaturer förväntas ge en ny biologisk underindelning av BC och bättre bedömning av prognos speciellt inom den ER+/luminala tumör-subtypen. Hel-genom-sekvensering ger ytterligare en mer nyanserad bild och etiologisk förklaring till tumör-uppkomst och progression. En stor andel trippel- (ER, PR, HER2) negativ BC kan härledas till defekt DNA reparation och ge förutsättningar till målinriktad behandling. Sannolikt finns en motsvarande undergrupp även i ER+ BC. Dessa studier kan även spegla mekansimer för ärftlig bröstcancer.