Pontén, Jan Fredrik – Single cell characterization of the step wise evolution of sun damage related skin cancer

Bakgrund

Huden består av flera celltyper, främst keratinocyter. Keratinocyter kan indelas i olika subgrupper som är svåra för ögat att identifiera, men skiljer sig på protein- och RNA-nivå. Mycket är känt gällande genetiska mutationer vid utveckling av hudtumörer, men kunskapen om hur dessa påverkar omgivande strukturer och immunreaktion är fragmentarisk. Kunskap saknas även om fördelning och roll av olika subgrupper av celler, vilka specifika förändringar de genomgår vid cancerutveckling, och hur de påverkas av skador uppkomna av UV-ljus respektive åldrande. Tumörutveckling går bortom mutationer, men en tydlig kartläggning av dessa processer saknas.

Beskrivning

Precis som för tidigare ansökningar till Cancerfonden, kommer projektet ske i nära samarbete med the Human Protein Atlas (HPA). Här finns en utvecklad metod för att skapa multidimensionella vävnadsmodeller genom att kombinera avancerad singelcellkaraktärisering med bioinformatik, vilken kommer användas i projektet. En unik samling vävnadsprover från hud, tagna från solexponerad respektive icke solexponerad yta från patienter i olika åldrar, kommer analyseras. Fokus är olika subgrupper av hudceller respektive immunceller för vilka väldokumenterade profiler finns, och hur aktivering och sammansättning ändras beroende på ålder och exponering.

Mål

Målet är att skapa en modell för att studera förändringar i huden vid åldrande, solexponering och tumörutveckling. Fokus ligger på att identifiera fördelningen av olika subgrupper av hudceller, hur detta ändras över tid och genom olika exponering, men också vilka utvecklingssteg de enskilda cellerna genomgår under denna process. På samma vis kommer sammansättningen av immunceller, framförallt NK-celler, att analyseras. Det långsiktiga målet är att kartlägga hudens olika celltyper och förstå vad som, utöver mutationer, driver hudcancerutveckling, och att identifiera mekanismer som driver cancerutveckling i solexponerad hud.