Molecular characterization of breast cancer: biomarkers of risk, prognosis and treatment

Bakgrund

Bröstcancer (BC) är en heterogen sjukdom både avseende tumörbiologi och kliniskt förlopp. En noggrann karakterisering av konstitutionella genetiska varianter, förvärvade somatiska mutationer och förändrade gen-uttryck medger bättre möjligheter att bedöma risk, ger en mer nyanserad tumörklassificering och bättre förutsägelse av prognos och behandlingssvar.

Beskrivning

Projektet utnyttjar etablerade populations-baserade patientkohorter, biobank-resurser och forskning-klinik nätverk. Det nationella SWEA projektet har medfört att nya validerade gener införts i klinisk cancergenetik. Data från gen-panel-screening av 4500 familjära BC fall, liksom material av friska kontroller och oselekterade BC fall studeras i samarbete med internationella konsortier. I SCAN-B projektet har >13500 BC patienter inkluderats och RNA från >9500 primärtumörer har sekvenserats för utveckling av nya biomarkörer. RNA-seq klassificerare överensstämmer väl men ger även ett mervärde till de etablerade histopatologiska markörerna.

Mål

Gen-signaturer förväntas ge en ny biologisk underindelning av BC och bättre bedömning av prognos speciellt inom den ER+/luminala tumör-subtypen. Hel-genom-sekvensering ger ytterligare en mer nyanserad bild och etiologisk förklaring till tumör-uppkomst och progression. En stor andel trippel- (ER, PR, HER2) negativ BC kan härledas till defekt DNA reparation och ge förutsättningar till målinriktad behandling. Sannolikt finns en motsvarande undergrupp även i ER+ BC.