Bernitz, Mats Bo Johan – Studying co-evolution of cancer and T-Cell clones in breast cancer tumors through In Situ Sequencing

Bakgrund

Immunsystemet spelar en viktig roll för att eliminera cancerceller från kroppen. Hos cancerpatienter har immunsystemet misslyckats med det. De flesta cancerbehandlingar utgår från att slå ut cancerceller och när de gör det kan de också ge immunsystemet förmåga att slå ut de cancerceller som överlever, och en kurativ behandling uppnås. Tyvärr händer inte detta för alla patienter, troligen på grund av sammansättningen av tumörer, uppbyggda av olika genetiska subkloner. Vi har utvecklat en unk teknik som gör det möjligt att samtidigt kartlägga subkloners utbredning i vävnadssnitt från tumörer samt immunsystemets aktivitet hos subklonerna.

Beskrivning

Vi kommer studera tumörmaterial från bröstcancerpatienter som genomgått olika läkemedelsbehandlingar. Vi har material från före, under och efter behandling från samma patient. Vi kommer använda vår in situ sekvenseringsteknik att kartlägga hur det sub-klonala landskapet förändras under behandling och samtidigt hur T-cellerna i immunsystemet utvecklas i relation till sub-klonernas utveckling.

Mål

Vi hoppas finna gemensamma drag i T-cellsresponsen som kännetecknar de subkloner som effektivt behandlas, och på motsvarande sätt för de subkloner som inte svarar på behandling. Med denna kunskap hoppas vi kunna definiera markörer som kan användas för diagnostik och val av behandling, samt hitta mekanismer som kan utgöra mål för nya behandlingar.