Ahmadian, Afshin – Multi-omics profiling of single exosomes for early detection of measurable residual disease

Bakgrund

Att tidigt kunna upptäcka cancer genom ett enkelt blodprov skulle vara ett genombrott och rädda liv. Konceptet är dock svårt att genomföra eftersom biomarkörer som tyder på cancer finns i mycket låga nivåer i blodet och dessutom finns vid många normala tillstånd. Nuvarande teknologier saknar därmed känslighet som krävs för tidig upptäckt. Vi har en lösning på detta, som innebär en ny teknik som fokuserar på exosomer som tumörceller utsöndrar i blodet. Vår teknik gör det möjligt att upptäcka cancer i tidigt stadie genom kombinerad analys av exosomers ytproteiner och deras innehåll (transkriptom) med singel-exosom-upplösning.

Beskrivning

Tjocktarmscancer är en av de vanligaste orsakerna till cancerdöd i Sverige och i världen. Ungefär 25% av patienterna som behandlas får återfall inom 24 månader. Detta beror på att cancerceller, trots behandling, finns kvar i kroppen och väntar på tillväxt. Återfall är svåra att upptäcka i ett tidigt stadie då de är mycket små och inte ger symptom, och när det upptäcks är det vanligtvis för sent för effektiv behandling med hög dödligheten. I detta projekt presenterar vi en teknik för tidig upptäck av cancer som skulle möjliggöra snabb behandling och därigenom öka överlevnaden avsevärt.

Mål

Exosomer är ideala cancermarkörer, men deras tillämpbarhet vid cancerscreening har hindrats av en brist på teknologier som kan hitta det fåtal exosomer i blodet som är utsöndrade av cancercellerna. Vårt mål i detta projekt är att presentera en teknik som tillförlitligt och kostnadseffektivt möjliggör analys av både RNA och ytproteiner (multi-omics) hos miljontals enskilda exosomer. Kombinationen av multi-omics och det massiva antalet exosomer som analyseras kan identifiera och skilja ”cancer-exosomerna” från exosomer som utsöndras av normala celler i blodet. Detta möjliggör tidig upptäckt av cancer.