Kutter, Claudia Antje – Discovery and characterization of liver cancer-specific RNA regulation

Bakgrund

Levercancer är vanligt och endast ett fåtal patienter lever fortfarande ett år efter diagnosen. Trots det växande antalet patienter och den höga dödligheten är alternativen för tidig diagnos och behandling fortfarande begränsade. Detta beror på att vi fortfarande saknar kunskap om hur cancercellen använder det genetiska materialet för att få celler att växa onormalt. Genom att analysera data från många patienter med levercancer har min grupp nyligen identifierat nya regulatorer som påverkar tillväxten av cancerceller. Dessa regulatorer har tidigare förbisetts eftersom de antar nya roller i cancer, vilket tidigare forskning inte beaktat.

Beskrivning

Dessa nya nyckelregulatorer kallas RNA-bindande proteiner (RBP). Dessa proteiner styr hur det genetiska materialet (RNA) används. Vi har utvecklat nya experimentella och specifika bioinformatiska metoder för att förstå mekanismerna bakom hur RBP ger upphov till olika RNA-molekyler vid levercancer. Vi kommer kartlägga hur de olika RBP-RNA-paren bidrar till levercancer, ändra deras mängder i cancercellen och observera skillnader i celltillväxt och behandlingssvar.

Mål

Att få mer kunskap om kontrollen av vårt genetiska material är avgörande för att möta en viktig utmaning inom cancerforskningen. Genom att utforska mekanismerna genom vilka RBP och RNA interagerar i cancer; och hur dessa interaktioner skiljer sig från de i normala celler, kan vi erhålla kunskap som kan appliceras inte bara för cancerdiagnos och prognos utan också för att utveckla strategier för mer riktad cancercellsterapi. Detta skulle vara ett kraftfullt komplement till befintliga metoder.