Lindstedt, Malin Marie – Myeloid cell molecular programs that shape head and neck tumor immunity

Bakgrund

Tonsillcancer (TC) är en form av huvud- och halscancer traditionellt orsakad av rökning och alkoholöverkonsumtion. Under de senaste årtiondena har antalet fall av TC kopplat till hög-risk humant papillomvirus (HPV) ökat markant. Ökad kunskap om tumörers immunologiska heterogenitet kan t.ex. leda till nya prognostiska biomarkörer och behandlingsprinciper. Standardiserade diagnostiska metoder för TC är väl utvecklade, men nya immunterapeutiska behandlingsformer kräver nya metoder för att identifiera vilka patientgrupper som kan svara på denna behandling.

Beskrivning

I detta projekt avser vi att utveckla protein-baserade metoder för att kunna studera cellulära mekanismer och distribution av myeloida populationer i vävnadsprov av TC, samt analysera dess frekvens, receptoruttryck och funktion i färsk tumörvävnad och blod före och efter behandling. Nya biomarkörer och cell-specifika gensignaturer har blivit identifierade genom single-cell sekvensering av tumör-infiltrerande myeloida celler, och hög infiltration av vissa celltyper har korrelerats till förbättrad överlevnad, vilket nu behöver följas upp i ett större kliniskt material.

Mål

Målet är att identifiera biomarkörer och mekanismer som kan förbättra immunterapi av huvud- och halscancer. Tekniker såsom RNA analys av enskilda celler och spatial profilering av vävnadsprov ger oss information om uttrycksnivåer och distribution av immuncellsmarkörer och receptorer relevanta för immunterapi. Dessa resultat kommer att analyseras mot virus-status och kliniska parametrar såsom överlevnad, och kan ge värdefull information relevant för prognostisering och val av behandling. I projektet avser vi även att studera immunhämmande och aktiverande mekanismer av relevans för läkemedelsutveckling.