Hallberg, Lars Einar Paul – Chromatin organization in differentiation and cancer.

Bakgrund

Lamin A (ett perifert kärnmembranprotein organiserar arvsmassan och är viktig för celldifferentiering) är ned-reglerat i många cancersjukdomar. I neuroblastom, är oförmågan till differentiering kopplat till ökad aggressivitet hos cancern och sämre prognos. Hur lamin A och hittills oidentifierade kärnmembranproteiner samverkar i omorganiserandet av arvsmassan vid celldifferentiering är i stora delar outrett. Vi har utvecklat en ny metod (FRIC) för att studera omorganisation av arvsmassan under celldifferentiering och planerar nu använda metoden för att studera arvsmassans organisering i differentierande neuroblastom-celler.

Beskrivning

Vi planerar att implementera FRIC i SciLifeLabs CBCS screening plattform för att möjliggöra screening av s.k., siRNA bibliotek i syfte att identifiera nya membranproteiner som deltar i att binda arvsmassan i cellkärnans periferi. Identifierade proteiner undersöks för sin roll i den lamin A beroende bindningen av arvsmassan under differentiering av neuroblastom-celler. Senare i projektet planeras liknande screening och undersökningar i andra cancermodellsystem kopplad till nedreglerad lamin A beroende differentiering.

Mål

Genom att identifiera och studera de proteiner som binder arvsmassan i cellkärnans periferi hoppas vi bättre kunna förstå den bristande differentieringsgraden i cancerformer med ned-reglerat lamin A, vilket är viktigt för utveckling av terapiformer i framtiden. Våra studier förväntas även leda till nya och bättre markörer vid cancerdiagnostik och identifiering av nya genetiska riskfaktorer. Implementeringen av FRIC i SciLifeLabs CBCS screeningsplattform möjliggör även för andra forskare inom ”life science” eller tillämpad biomedicin att studera andra cancersjukdomar som är associerade med felaktig organisation av arvsmassan.