Benson, Per Johan Mikael – Digital twins for early and personalised medicine in colorectal cancer

Bakgrund

Tidig diagnos och individualiserad medicinering är viktiga för överlevnad vid cancer. Detta kompliceras av att varje tumör kan innehålla olika sorters tumörceller, som var för sig uttrycker tusentals olika gener. Även omgivande celler är viktiga eftersom de kan både motverka eller bidra till tumörtillväxt. Det är svårt att finna diagnostiska markörer och mediciner som är effektiva för så komplicerade förändringar. Tack vare stöd från Cancerfonden har vi utvecklat metoder som kan bidra till att lösa dessa problem, genom att studera tjock- och ändtarmscancer, som är en av de vanligaste cancersjukdomarna.

Beskrivning

Vi vill konstruera digitala tvillingar av enskilda tumörer. Tvillingarna databehandlas med tusentals olika mediciner för att finna den som passar bäst för patienten. Vi kommer också att analysera tvillingarna för att finna diagnostiska biomarkörer. Tvillingarna konstrueras genom att analysera tumörerna med en metod som gör det möjligt att bestämma aktiviteten hos tusentals olika gener i tusentals enskilda celler i tumörerna. Sedan använder vi nätverksmetoder för att organisera cellerna i nätverk, som beskriver vilka funktioner de har, hur de samverkar, vilka celler och gener som är viktigast, samt vilka mediciner de är mest känsliga för.

Mål

Vårt slutmål är att varje enskild cancerpatient ska ha sin egen digitala tvilling för tidig och skräddarsydd behandling. Tvillingarna ska utformas så att de kan användas av både patient och läkare för att de i samråd ska kunna bestämma behandlingen. Tvillingarna ska också göras tillgängliga för forskning för att förbättra cancervård. Detta projekt syftar till att visa att detta är möjligt för patienter med tjock- och ändtarmscancer, och därigenom bidra till utveckling och spridning av metoderna till forskning och klinisk implementering inom cancervården.