Lindh, Olof Magnus – Virala och chimära transkript i levervävnad med eller utan cancer vid kronisk hepatit B-virusinfektion

Bakgrund

Hepatit B-virus (HBV) är en av de viktigaste orsakerna till cancer alla kategorier. WHO klassade 2015 HBV som en viktigare dödsorsak än HIV, malaria och tuberkulos. Två huvudförklaringar till att HBV orsakar cancer är kronisk inflammation och att HBV-DNA slumpvis sätts in i (integreras) mänskliga arvsmassan och kan uppreglera eller nedreglera gener som ska kontrollera cellernas aktivitet och förökning. De flesta med kronisk HBV-infektion smittas i barndomen. Hos ca 20% leder integration och inflammation till cancer, vanligen efter 40 års ålder. Vilka som kommer att drabbas är svårt att förutse. Vid ökad cancerrisk ges antiviral bromsmedicin.

Beskrivning

Vår forskning undersöker hur virusfaktorer påverkar leverskadan vid kronisk hepatit B, och hur man kan avgöra vilka patienter som behöver antiviral behandling. Vi har särskilt studerat koncentrationen av virus-DNA i blodet och genetiska skillnader mellan olika virusstammar. I det aktuella projektet studerar vi i levervävnadsprover med molekylärbiologiska metoder som vi utvecklat hur vanligt det är att virus-DNA infogas i mänskligt DNA, när under förloppet detta sker, var i kromosomerna det hamnar, hur detta integrerade DNA läses av, och vilka effekter det kan ha på tumörutveckling och diagnostik av hepatit B.

Mål

Våra tidigare fynd tyder på att HBV-DNA integreras i mänskligt DNA i alla infekterade leverceller. Vi vill nu detaljstudera dessa integrationer och deras effekter med särskilda molekylärbiologiska metoder, bl.a. djupsekvensering. Vi ska fokusera på våra tidigare fynd och i detalj studera integrationernas sammansättning och hur de läses av och eventuellt bildar onormala proteiner, undersöka en mekanism som kanske kan förklara att virusnivån i blodet minskar, och testa en hypotes som kan förklara varför hepatit D ofta orsakar skrumplever. Dessa studier kommer att ge viktig kunskap om den ökade cancerrisken vid HBV-infektion.