Nilsson, Karin Birgitta – Deciphering non-coding mutations in brain tumors and targeting the tumor microenvironment

Bakgrund

Mål 1: Cancer orsakas av mutationer som påverkar cellernas tillväxt och delning. Tidigare forskning har främst fokuserat på mutationer i de cirka två procent av vårt DNA som kodar för proteiner. Däremot är mycket mindre känt om de återstående 98 procenten av vårt DNA. Dessa icke-kodande områden kan också spela en roll i cancerutveckling. Vi har nu utvecklat en systematisk metod att undersöka icke-kodande mutationer i hjärntumörer. Mål 2: Sammansättningen av molekyler runt cellerna i vår hjärna består till stor del av proteoglykaner (proteiner med kolhydratkedjor). Dessa påverkar tumörutvecklingen.

Beskrivning

Mål 1: Vi använder helgenomsekvenserat DNA från hjärntumörer. Vår hypotes är att DNA-sekvenser som förblivit oförändrade genom evolutionen har viktiga funktioner. Genom att samköra cancerns mutationer med ny kunskap om hur arvsmassan utvecklats under evolutionen fokuserar vi på mutationer i de bäst bevarade genetiska regionerna. Därefter testas de i laboratoriet. Mål 2: Vi undersöker hur biomolekyler som kallas proteoglykaner påverkar tillväxt av elakartade hjärntumörer. Vi har funnit att enzymet heparanase, som bryter ner proteoglykaner, driver hjärntumörers aggressivitet och verifierar nu om dess blockering kan stoppa tumörtillväxt.

Mål

Målet är att våra resultat ska kunna användas för att stoppa hjärntumörcellers tillväxt och spridning. Sådan kunskap behövs för att ta fram ny behandling av glioblastom, som har snabbt förlopp och ytterst dålig prognos och för medulloblastom, där inte alla patienter kan behandlas med gott resultat.