NK-celler är lymfocyter som med hjälp av receptorer kan känna igen och döda cancerceller. På senare år har försök gjorts att förstärka NK-cellers funktion och därigenom finna nya sätt att behandla patienter som har drabbats av cancer. En av de viktigaste NK-cellsreceptorerna heter NKp46. Vår forskargrupp har nyligen upptäckt att NKp46 binder till ett annat protein på NK-cellen som heter TRAIL och tillsammans kan dessa två känna igen cancerceller.
I det här forskningsprojektet vill vi lära oss mer om hur NKp46 och TRAIL binder varandra. Vi försöker förstå vilka delar av proteinet som är viktiga för att dessa proteiner ska binda till varandra. Till vår hjälp har vi AI-baserade metoder som kan prediktera hur två olika proteiner sitter ihop. Ett mål är göra förändringar i proteinerna så att de binder starkare till varandra. Vi kommer också att använda jästceller för att ”visa upp” olika varianter av exvis TRAIL. Vi kan sedan testa vilka varianter som NKp46 binder bäst till. Jästcellerna som visar upp de ”bästa” varianterna kan isoleras och vi kan sedan producera just dessa proteiner.
Med hjälp av vår forskning vill vi förstå mer om hur NKp46 och TRAIL samverkar för att avdöda cancerceller. På sikt hoppas vi kunna utveckla nya behandlingar utifrån denna upptäckt. En möjlighet skulle kunna vara att skapa modifierade NK-celler som bär på förbättrade varianter av NKp46 och TRAIL. Ett annat mål med projektet är att klargöra hur tumörceller undviker att upptäckas av NKp46 och TRAIL och hitta strategier för att motverka detta.