Jakobsson, Johan Einar – A role for transposable elements in brain tumors

Bakgrund

I dagsläget så saknas de effektiv behandling av hjärntumörer. Det är därför mycket viktigt att nya idéer testas i detta forskningsområde. I detta projekt så kommer vi studera hur förändringar i DNA metylering påverkar hur våra gener används i hjärntumörer. Vi kommer att fokusera på transposabla element, en del av vår arvsmassa som hittills är i princip outforskad men som är nära kopplad till DNA-metylering. Transposabla element är virala genfragment i vårt DNA, som finns kvar som en rest från gamla virusinfektioner. Våra preliminära data tyder på transposabla element aktiveras i hjärntumörer på grund av förändringar i DNA metylering.

Beskrivning

Nyckeln till projektet ligger i användandet av en ny metod som möjliggör analys av DNA metylering av transposabla element som vi har utvecklat. Med hjälp av denna avancerade sekvenseringsteknik kommer vi att studera hur förändringar i DNA-metylering styr hur arvsmassan används i vävnadsprover från mänskliga hjärntumörer. Denna teknik är unik då den är baserad på extra långa sekvenseringsavläsningar, vilket behövs då transposabla element är repetitiva. Med hjälp av denna nyskapande teknik så kommer detta projekt att leda till en unik insikt i de molekylära mekanismer som bidrar till hjärntumörers uppkomst och tillväxt.

Mål

Målet med vår forskning är att förstå hur transposoner bidrar till uppkomst och progression av hjärntumörer. Studier av transposabla element i tumörer är dock svåra att genomföra. Genom att vi i vårt projekt kommer att använda en helt ny teknik som möjliggör studier av molekylära mekanismer i mänskliga vävnadsprover kommer vi få fram unik information. På många sätt har därför detta projekt en potential för att bli revolutionerande i studier av hjärntumörer. Detta är ett projekt med mycket hög originalitet.