Sunnerhagen, Per Johan – Cellular environment: impact on nonsense-mediated decay

Bakgrund

I våra tidigare studier av genreglering på RNA-nivå blev det tydligt hur den cellulära miljön påverkar vilka gener som aktiveras eller stängs ned. Eftersom tumörceller ofta har en starkt avvikande miljö som kännetecknas av olika typer av stress, t.ex. då de utsätts för cancerläkemedel eller brist på syre eller näring, blev det naturligt att se om denna skillnad kunde utnyttjas för att specifikt påverka cancercellernas genuttrycksmönster, för att bromsa deras tillväxt.

Beskrivning

Det fenomen vi studerar kallas ”nonsens-medierad nedbrytning” (NMD) och är en mekanism för att bryta ned mRNA-molekyler. NMD kan alltså dämpa uttrycket av vissa gener, och reagerar på specifika signatursekvenser i RNA. Mutationer som aktiverar NMD finns ofta i cancerceller, liksom i kroppen hos dem med vissa ärftliga former av cancer, och bidrar till cancerns utveckling. Vi skall bättre kartlägga vilka egenskaper signatursekvenserna har. Vi skall också utnyttja att cancerceller är mer utsatta för stress till att rikta inhibitorer mot en stresspecifik form av det centrala NMD-proteinet.

Mål

Vårt mål är att hitta sätt att påverka NMD i en tumör på sätt som bromsar cancerutvecklingen med ett minimum av skada på den friska vävnaden. Det skulle ge möjligheter att förstärka effekten av cellgifter eller strålbehandling, eller att med riktad terapi påverka just de gener i tumören som är muterade och driver på cancerutvecklingen.