Kanduri, Chandrasekhar – Delineating the functional role of protein coding and non-protein coding antisense RNAs in cancer development and progression.

Bakgrund

Antisens icke-kodande långa RNA molekyler (lncRNA) är den största undergruppen av icke-kodande mRNA. De överlappar ofta mRNA i den komplementära RNA-strängen, sense-strängen, alltså den som används när proteiner bildas. Även om de flesta lncRNA inte ger upphov till proteiner, kan vissa göra det. Forskning visar att dessa små peptider eller proteiner kan spela roll vid uppkomst och tillväxt av tumörer. Hur de påverkar normala celler och hur de kan leda till cancer, vet vi däremot inte. För att fylla kunskapsluckorna behövs mer forskning för att förstå hur dessa små proteiner kontrollerar olika processer i cellen.

Beskrivning

Projektet undersöker vilken roll två antisens-RNA spelar för cancer. Det ena, ARHGEF17-AS1, ger upphov till ett nytt protein medan det andra, ATXN1-AS1, inte gör det. Vi hittade dessa antisens-RNA när vi screenade RNA i två cellprocesser som spelar stor roll för cancer: cellcykeln med de steg celler går igenom innan de delas, och differentieringen där celler mognar till sin slutliga celltyp. ARHGEF17-AS1 är alltså inte bara ett RNA, det kodar också för ett nytt protein som kallas MSEP. Utan MSEP kan cellen inte dela sig normalt. ATXN1-AS1 hindrar tumörbildning genom att stimulera bildningen av kalciumkanalsproteinet CACNA2D3.

Mål

Våra opublicerade data tyder på att proteinet MSEP behövs för celldelning. I projektet ska vi i cellodling undersöka hur MSEP och de proteiner det samspelar med kontrollerar celldelning i normala celler och i cancerceller. Vi ska undersöka om MSEP kan vara ett möjligt mål för ny cancerbehandling. Vår tidiga forskning tyder på att CACNA2D3 kan spela roll för spridning av cancer. I projektet vill vi försöka förstå hur det kommer sig att cancer sprider sig när det råder brist på CACNA2D3. Genom att studera de signalvägar som aktiveras när CACNA2D3 inte fungerar som det ska, hoppas vi hitta ett nytt sätt att behandla neuroblastom.