Söderberg, Jan Ola – USING AN ENGINEERED DNA POLYMERASE TO UNCOVER THE MECHANISMS OF TUMOR INITIATION AND PROGRESSION

Bakgrund

Utveckling av nya metoder är en förutsättning för att driva forskningen framåt. I detta projekt kommer vi att utveckla metoder som möjliggör studier på de processer som leder till uppkomsten av cancer och hur cancern utvecklas. Dessa metoder är baserade på vårt unika DNA-kopierande enzym (DNA-polymeras), som vi kallar Sloppymerase. Sloppymerase är ett artificiellt DNA-polymeras, som nyligen har konstruerats av vår forskningsgrupp. Det unika med Sloppymerase är att det är extremt felbenäget och kan bryta ned DNA och stoppa in felaktiga baser (dvs ger upphov till mutationer).

Beskrivning

I detta projekt kommer vi att utveckla en metod för att bestämma var DNA-skador sker i en cell. DNA-skador kan till exempel uppkomma på grund av strålning eller giftiga kemikalier. En felaktigt lagad DNA-skada ger upphov till mutationer eller andra förändringar av DNA och leder till uppkomst av cancer. Vi kommer också att utveckla ett modellsystem för att kunna studera uppkomsten av cancer, där mutationshastigheten kan ökas i utvalda celler. Genom att stoppa in Sloppymerase i en cells DNA och sätta det under kontroll av en inducerbar promotor kommer att mutera och bli mer och mer cancerlika.

Mål

Det finns för närvarande inget modellsystem där man kan studera hur en normal cell omvandlas till en cancercell. Vårt modellsystem kommer efterlikna de processer som sker hos cancerpatienter i celler som man kan odla i ett laboratorium. Med vårt modelsystem kommer vi att kunna studera vad som händer när cancer bildas och hur vissa cancerceller undgår att dödas av en behandling. En bättre förståelse av dessa processer kommer att ge förutsättningar att utveckla nya behandlingar.