Jakobsson, Johan – EPIGENETICS AND GLIOBLASTOMA: A ROLE FOR LINE-1 TRANSPOSABLE ELEMENTS

Bakgrund

Trots intensiv forskning så saknas det i dagsläget effektiv behandling av hjärntumörer. Det är därför mycket viktigt att nya idéer testas i detta forskningsområde. Fram till nu så har den största delen av molekylär forskning på hjärntumörer fokuserat på den delen av arvsmassan som kodar för protein. Vår hypotes är dock att en del av nyckeln till att förstå hjärntumörer finns att hitta i det DNA som är icke-kodande. Icke kodande-DNA gör inga proteiner och definieras inte som gener. Detta har lett till att denna del av arvsmassan ofta försummas i forskningsstudier. Detta är anmärkningsvärt då endast 2% av människans DNA består kodande sekvens.

Beskrivning

I det här projektet kommer vi studera den typen av icke-kodande DNA som kallas transposoner, vilka är repetitiva DNA-sekvenser som utgör mer än 50% av vårt DNA. Transposoner är virusliknande DNA-sekvenser som under miljontals år har inkorporerats i vår arvsmassa. Nya data från vårt lab tyder överraskande på att transposoner kanske spelar en viktig roll i hjärntumörer. I detta projekt kommer vi att undersöka och klarlägga den roll som transposoner spelar för utveckling och progression av hjärntumörer. Vi kommer att använda oss utav CRISPR-geneditering som inaktiverar utvalda transposoner och låter oss undersöka dess påverkan på tumörceller.

Mål

Målet med vår forskning är att förstå hur transposoner bidrar till uppkomst och progression av hjärntumörer. Om vår hypotes stämmer så kommer detta öppna upp för helt ny förståelse av de molekylära mekanismerna som driver hjärntumörer. På lång sikt kommer detta leda till nya behandlingsstrategier.