Zaphiropoulos, Peter-George – Circular RNAs in medulloblastoma development

Bakgrund

I en tumör uttrycks gener på ett helt annat sätt än i en frisk vävnad. Det är sådana skillnader i genuttrycket som gör att en frisk cell kan omvandlas till en tumörcell. Genuttrycket avspeglas i budbärar-RNA som ger upphov till olika proteiner i en frisk cell i jämförelse med en tumörcell. Men genuttrycket ger inte upphov till bara budbärar-RNA. Ny forskning visar på att en gen kan också producera RNA molekyler som skiljer sig markant från budbärar-RNA. De nya molekylerna som har upptäckts är inte linjära som budbärar-RNA utan istället cirkulära.

Beskrivning

Forskningen har visat att cirkulära RNA, som är mer stabila är linjära RNA, interagerar med andra biomolekyler och detta kan påverka de egenskaper en cell eller en vävnad har. Specifikt, har det bevisats att cirkulära RNA kan påverka utvecklingen av en tumör och agerar som onkogener eller tumörsuppresorgener. Projektet ska fokusera på hur genuttryck i lillhjärnan förändras vid omvandling av celler till medulloblastom. Vi ska inte bara analysera budbärar-RNA men också cirkulära RNA. Den övergripande analysen kommer inkludera både linjära och cirkulära RNA vilket skulle ge en helhetsbild av alla skillnader i genuttrycket.

Mål

Projektets syfte är att undersöka en ny mekanism om hur genregleringen kan påverka utvecklingen av hjärntumörer. Förhoppningsvis kommer projektet ge ledtrådar om nya markörer för tidig upptäckt av cancer i lillhjärnan och på längre sikt även ha betydelse för nya terapeutiska behandlingar.