Sjöberg, Britt-Marie Kristina – Enzymatisk reduktion av ribonukleotider

Bakgrund

Alla celler tillverkar nya DNA-byggstenar på samma sätt genom att använda RNA-byggstenar som utgångsmaterial. Enzymet som möjliggör tillverkningen kallas RNR (en förkortning för det vetenskapliga namnet RiboNukleotidReduktas). Om RNR inte fungerar kan cellen inte tillverka nya byggstenar och inte heller kopiera sitt DNA, vilket innebär att cellen inte kan dela sig. Det betyder att celltillväxten hämmas när RNR stängs av. Sjukdomsalstrande bakteriers RNR har ofta annorlunda egenskaper än människans RNR. Den kunskapen kan utnyttjas för att utforma specifik behandling av cancerpatienter som ofta råkar ut för allvarliga infektioner.

Beskrivning

Vi kartlägger unika karaktärsdrag hos RNR-enzym i vanligt förekommande bakterier som orsakar fatala infektioner hos cancerpatienter, för att hitta specifika angreppspunkter hos dessa sjukdomsalstrande bakteriers RNR. Under mer än ett decennium har vi byggt ett bioinformatiskt klassifieringssystem för RNRer som vi använder för att identifiera potentiellt unika egenskaper hos patogeners RNR. Vi kartlägger dessa egenskaper med molekylärbiologiska, biokemiska och strukturbiologiska tekniker och bestämmer hur de skiljer sig från människans RNR. Vi kartlägger även hur tillverkningen av patogeners RNR regleras och kan stängas av.

Mål

Multiresistenta sjukdomsalstrande bakterier blir allt vanligare och det är redan svårt att hitta adekvat behandling av infektioner hos cancerpatienter som genom sin sjukdom och sin behandling är extra känsliga för infektioner. Utan verksamma antibiotika finns risken för mycket allvarliga komplikationer och ökad dödlighet pga svårbehandlade infektioner hos en stor del av cancerpatienterna. Genom att identifiera specifika egenskaper hos RNR från sjukdomsalstrande bakterier hoppas vi hitta angreppspunkter för specifika hämmare som slår ut patogenen utan att påverka de mänskliga cellerna.