Single-cell transcriptomics and epigenomic transitions: from oligodendrocyte precursors to glioma initiating cells and immune oligodendroglia

Bakgrund

Alla kroppens celler bär på samma genetiska material, det så kallade genomet. Precis som olika dirigenter kan göra olika tolkningar av noterna till ett musikaliskt stycke beroende av vilka instrument som sitter med i orkestern, så kan olika celler tolka ett visst genom på olika sätt beroende av vilka molekyler som finns i cellen. På detta vis kan tumörceller tolka genomet annorlunda än normala celler, vilket leder till specifika kemiska modifieringar av den genetiska koden och okontrollerad delning av cellerna.

Beskrivning

I denna studie kommer vi att jämföra tumörceller från gliom med normala celler. Genom att använda de allra senaste teknikerna som enkelcells-RNA-sekvensering och enkelcells-ATAC-Seq kommer vi att kartlägga stegen som uppträder mellan transformationen av normala oligodendrocytprogenitorceller och celler i gliomen som är ansvariga för dess tillväxt. Vi har också nyligen observerat att oligodendrocytprogenitorceller kan förvärva egenskaper av immunceller i multipel skleros och vi kommer att avgöra om detta är fallet i en musmodell av gliom och huruvida dessa celler modulerar tumörutveckling.

Mål

Detta projekt kommer att bidra till nya perspektiv på hur gliom utvecklas och identifiera nya angreppspunkter for behandling. Den långsiktiga målsättningen är att utveckla läkemedel som kan nedreglera aktiviteten hos de molekylar som bidrar till gliomets utveckling och fortlevnad.