Screening av biomarkörer baserade på epigenom och epitranskriptom analyser, i kronisk lymfatisk leukemi (CLL).

Bakgrund

KLL är den vanligaste leukemiformen hos vuxna i Sverige och anses allmänt som en obotlig sjukdom. Som sjukdom är KLL biologiskt och kliniskt heterogen med mycket varierande kliniskt förlopp. För KLL finns idag väl etablerade prognostiska genetiska markörer, men kunskapen är begränsad vad gäller betydelsen av globala metyleringsförändringar vid dessa sjukdomar. Vi var först med att studera globala metyleringsprofiler i olika prognostiska undergrupper av KLL och MCL. Vi har kunnat identifiera flera gener med olika metyleringsmönster och som potentiellt kan ha både prognostisk och funktionell betydelse i patogenesen av dessa sjukdomar.

Beskrivning

Det övergripande målet för det aktuella projektet är att identifiera nya epigenetiska biomarkörer och att klarlägga deras funktionella betydelse i utveckling och progression av KLL. För att utforska vilken roll RNA-metylering har i sjukdomsutvecklingen vid KLL, kommer vi att utföra analys av globala DNA- och RNA-metyleringsmönster. Studierna kommer att inkludera KLL-patienter tillhörande biologiskt och kliniskt väldefinierade prognostiska undergrupper. Slutligen, kommer vi också utforska målgener och funktionell betydelse av ett protein med en viktig roll i kromatinförändringar och som är ett potentiellt mål för riktad behandling vid KLL.

Mål

Den tekniska utvecklingen som medger analys av epigenetiska förändringa i hela genomet ger oss stora möjligheter att identifiera nya gener eller regioner, vars funktioner fortfarande är okänd eller ännu inte kopplade till utveckling av KLL och MCL. Eftersom epigenetiska förändringar är reversibla är dessa potentiella mål för terapeutisk intervention. För att detta ska bli framgångsrikt krävs dock ökad kunskap om dessa förändringas betydelse. Denna studie ger oss möjlighet att hitta nya biomarkörer och mål för läkemedelsbehandling men ger oss även möjlighet att upptäcka viktiga patogenetiska mekanismer bakom utvecklingen av dessa sjukdomar.